Team:KIT-Kyoto/PartsJ

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Language : English / Japanese

私たちはこれらのパーツを利用して、新たなbiobrickのパーツ作りに取り組みました

1.私たちはこれらのパーツを2010 iGEM kitから入手しました

Name	Part type	Resistance	Insert	Vector	Contents
<partinfo>pSB3k3</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>)	Plasmid backbone	Kanamycin	738bp	2750bp	promoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
<partinfo>pSB6A1</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>)	Plasmid backbone	Ampicillin	738bp	4032bp	promoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
<partinfo>pSB1C3</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>)	Plasmid backbone	Chloramphenicol	1069bp	2072bp	promoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I3522</partinfo>)	Composite	Ampicillin	937bp	2079bp	promoter(TetR)+RBS+GFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_R0040</partinfo>)	Regulatory	Ampicillin	54bp	2079bp	promoter(TetR)
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I732019</partinfo>)	Regulatory	Ampicillin	3230bp	2079bp	RBS+LacZ+T+T
<partinfo>pSB1AK3</partinfo>(<partinfo>BBa_I732950</partinfo>)	Protein domain	Kanamycin	3230bp	2079bp	RBS+LacZ+T+T
<partinfo>pSB4A5</partinfo>(<partinfo>BBa_K193602</partinfo>)	Composite	Ampicillin	1896bp	3395bp
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0240</partinfo>)	Protein domain	Ampicillin	883bp	2079bp	RBS+GFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I13507</partinfo>)	Protein domain	Ampicillin	937bp	2079bp	RBS+RFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0420</partinfo>)	Protein domain	Ampicillin	878bp	2079bp	RBS+CFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0430</partinfo>)	Protein domain	Ampicillin	878bp	2079bp	RBS+YFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I13600</partinfo>)	Composite	Ampicillin	940bp	2079bp	promoter(TetR)+RBS+CFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_J22005</partinfo>)	Composite	Ampicillin	2079bp	2623bp	promoter(TetR)+RBS+YFP+T+T

2.このパーツはiGEM本部から直接入手しました

私たちは2009年の東京工業大学のグループによって設計されたBioBrick Part(pSB6A1)に新情報を加えました。このBioBrick Partは、E.coliでGFPを発現するように設計された低コピープラスミドであるpSB6を骨格としています。一般に、低コピープラスミドは、pSB1のような高コピープラスミドと比較してタンパク質発現の効率が高い。しかしながら、このプラスミドに関してGFPタンパク質発現の効率に関する定量的なデータはiGEMのどんなサイトでも説明されていませんでした。よって、pSB6A1とpSB1A2のプラスミドをもつE.coliで生産されるGFPタンパク質の蛍光強度を測定しました。結果、pSB1A2をもつE.coliと比較してpSB6A1もつE.coliではGFPの発現レベルが高いことが明らかにわかりました。このようにして、我々はH₂O₂に応答する様々なプロモーターの活性を測定するのにpSB6のベクターを使用することに決めました。私たちは、2009年にこれを開発した東京工業大学のグループに感謝します。

Name	Part Type	Resistance	Insert	Vector
<partinfo>pSB6A1</partinfo>(<partinfo>BBa_K121013</partinfo>)	Protein domain	Ampicillin	883bp	4022bp	RBS+GFP+T+T

新たに作成、またはデザインしたパーツ

以下のパーツは、pSB6で作成しました。ハートマークを記載しているパーツはpSB1C3に置き換え、iGEM本部へ送付しました。

<groupparts>iGEM010 KIT-Kyoto</groupparts>