Team:Osaka/week12

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(Difference between revisions)
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==October 10 (Sun)==
==October 10 (Sun)==
-
#Electrophoresis
+
# Electrophoresis
-
dye 2μl, sample, ladder 5μl. 
+
-
1% Agalose gel  50V 5min  100V 23min
+
-
 
+
#Ligation
#Ligation
-
048(C)
+
#*048(C) R1 + FcenA
-
  R1 (ES)  10/3                      6μl
+
#*060(C) 001-2 + GeneⅢ
-
  FcenA (XP)  10/1                    2μl
+
#*051(C) R2 + 022
-
  1-3A(EP)  10/9                      2μl
+
#*066(A) 3-2P + 026  
-
  10×T4 DNA ligase Buffer        2μl
+
#*069(A) 049 + 026
-
  T4 DNA ligase                        0.5μl
+
#*070(A) 052 + 026
-
  DSW                                      7.5μl
+
#mini prep
-
  total                                        20μl
+
#*058①,051②,016①,013②
-
 
+
#cut check
-
060(C)
+
#*016①,058①,013②,051②,1-13D,050①,025②
-
  001-2 (ES)  9/27                  2μl
+
#*PCR Products(ADH2,ENO1)
-
  GeneⅢ(XP)  10/6                    6μl
+
#*Man→034
-
  1-3A(EP)  10/9                      2μl
+
#*glr→031
-
  10×T4 DNA ligase Buffer        2μl
+
#*ADH2→027
-
  T4 DNA ligase                        0.5μl
+
#*ENO→029
-
  DSW                                      7.5μl
+
#*Cel44A→075
-
  total                                        20μl
+
-
 
+
-
051(C)
+
-
  R2 (ES)  10/3                      6μl
+
-
  022 (XP)  10/1                        2μl
+
-
  1-3A(EP)  10/9                      2μl
+
-
  10×T4 DNA ligase Buffer        2μl
+
-
  T4 DNA ligase                        0.5μl
+
-
  DSW                                      7.5μl
+
-
  total                                        20μl
+
-
 
+
-
066(A)
+
-
  3-2P (ES)  10/9  GE              4μl        (gel extract)
+
-
026 (EX)  10/9  GE                  4μl
+
-
  10×T4 DNA ligase Buffer        2μl
+
-
  T4 DNA ligase                        0.5μl
+
-
  DSW                                      9.5μl
+
-
  total                                        20μl
+
-
 
+
-
069(A)
+
-
049 (ES)  10/9  GE                4μl
+
-
026 (EX)  10/9  GE                  4μl
+
-
  10×T4 DNA ligase Buffer        2μl
+
-
  T4 DNA ligase                        0.5μl
+
-
  DSW                                      9.5μl
+
-
  total                                        20μl
+
-
 
+
-
070(A)
+
-
052 (ES)  10/9  GE                4μl
+
-
026 (EX)  10/9  GE                  4μl
+
-
  10×T4 DNA ligase Buffer        2μl
+
-
  T4 DNA ligase                        0.5μl
+
-
  DSW                                      9.5μl
+
-
  total                                        20μl
+
-
 
+
-
16℃  1h  ,80℃  20min
+
-
 
+
-
3.mini prep
+
-
058①,051②,016①,013②
+
-
 
+
-
4.Treatment of restriction enzyme
+
-
cut check (check and assembly)
+
-
016① 10/10        15μl
+
-
Xba I                    0.5μl
+
-
Pst I                    0.5μl
+
-
10×NEbuffer2          5μl
+
-
100×BSA              0.5μl
+
-
H2O                    28.5μl
+
-
total                      50μl
+
-
 
+
-
plasmid                15μl
+
-
EcoR I                    0.5μl
+
-
Spe I                      0.5μl
+
-
10×NEbuffer2          5μl
+
-
100×BSA                0.5μl
+
-
H2O                        28.5μl
+
-
total                        50μl
+
-
 
+
-
058①,013②,051②,1-13D,050①,025②
+
-
 
+
-
dye 2μl, sample 10μl, ladder 5μl. 
+
-
1% Agalose gel  100V
+
-
 
+
-
5. Cel5B 3/4  α-agultinin PCR for DNA segment
+
-
thermal cycle
+
-
94℃  15sec
+
-
50℃  30sec 
+
-
74℃  30sec        2cycle
+
-
↓add flanking primer
+
-
94℃  15sec
+
-
62℃  30sec
+
-
68℃  1min    35cycle
+
-
72℃  10min
+
-
4℃      ∞
+
-
 
+
-
        5xPhusion HF Buffer        5μl
+
-
        10mM dNTP                      0.4μl
+
-
          tube  3                              0.2μl
+
-
          Cel5B  1/2                      0.2μl
+
-
          primer    rev                    0.2μl
+
-
                        fwd2                  0.2μl
+
-
          phusion                          0.2μl
+
-
            DSW                            13.6μl
+
-
          total                                20μl
+
-
 
+
-
α-agultinin PCR for DNA segment
+
-
98℃  30sec
+
-
98℃  10sec
+
-
72℃  30sec        35cycle
+
-
72℃  10min
+
-
4℃   ∞
+
-
 
+
-
        5xPhusion HF Buffer        5μl
+
-
          dNTPs                            0.4μl
+
-
          primer    rev                    0.2μl
+
-
                        fwd                  0.2μl
+
-
          phusion                          0.2μl
+
-
            DSW                              14μl
+
-
          total                                20μl
+
-
 
+
-
dye 2μl, sample , ladder 5μl. 
+
-
1% Agalose gel  100V 25min
+
-
 
+
-
6.To liquid culture
+
-
1-13D,1-12M,1-23L,013,056,069-2,061 →culture
+
-
37℃ incubate  1:00~
+
-
 
+
-
7.Transformation
+
-
10/10 ligation  048,060,051,066,069,070,1-13D
+
-
compitent cell ①50μl+DNA2μl
+
-
37℃ incubate  2:55~
+
-
 
+
-
8.PCR Products(ADH2,ENO1) treatment of restriction enzyme
+
-
PCR Products      15μl
+
-
EcoR I                    0.5μl
+
-
Spe I                      0.5μl
+
-
10×NEbuffer2          5μl
+
-
100×BSA                0.5μl
+
-
H2O                        28.5μl
+
-
total                        50μl
+
-
 
+
-
PCR Products(d)                    4μl
+
-
1-3A(ES,BB)                            4μl
+
-
  10×T4 DNA ligase Buffer        2μl
+
-
  T4 DNA ligase                        0.5μl
+
-
  DSW                                      11.5μl
+
-
  total                                          20μl
+
-
Man→034
+
#PCR for DNA segment
-
glr→031
+
#*Cel5B 3/4  α-agultinin
-
ADH2→027
+
#To liquid culture
-
ENO→029
+
#*1-13D,1-12M,1-23L,013,056,069-2,061 →culture
-
Cel44A→075
+
#Transformation
 +
#*048,060,051,066,069,070,1-13D

Revision as of 20:09, 27 October 2010


October 10 (Sun)

  1. Electrophoresis
  2. Ligation
    • 048(C) R1 + FcenA
    • 060(C) 001-2 + GeneⅢ
    • 051(C) R2 + 022
    • 066(A) 3-2P + 026
    • 069(A) 049 + 026
    • 070(A) 052 + 026
  3. mini prep
    • 058①,051②,016①,013②
  4. cut check
    • 016①,058①,013②,051②,1-13D,050①,025②
    • PCR Products(ADH2,ENO1)
    • Man→034
    • glr→031
    • ADH2→027
    • ENO→029
    • Cel44A→075
  1. PCR for DNA segment
    • Cel5B 3/4 α-agultinin
  2. To liquid culture
    • 1-13D,1-12M,1-23L,013,056,069-2,061 →culture
  3. Transformation
    • 048,060,051,066,069,070,1-13D