Team:Heidelberg/Modeling/descriptions
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- | One of the hardest tasks in the development of our models was to come up with good strategy to generate input parameters from the raw data. In our case, the raw data is the binding site sequence and the corresponding sh/miRNA-sequence. The final parameterization concept unites a basic distinction between perfect, bulged (near-perfect) and endogenous miRNA like BS, with the advanced 3'-scoring and AU-content evaluation. The endogenous miRNA like BS parameter is further split into the three | + | One of the hardest tasks in the development of our models was to come up with good strategy to generate input parameters from the raw data. In our case, the raw data is the binding site sequence and the corresponding sh/miRNA-sequence. The final parameterization concept unites a basic distinction between perfect, bulged (near-perfect) and endogenous miRNA like BS, with the advanced 3'-scoring and AU-content evaluation. The endogenous miRNA like BS parameter is further split into the three [https://2010.igem.org/Team:Heidelberg/Modeling#shRNA_binding_sites types of seed binding sites]. |
==Training Set Overview== | ==Training Set Overview== |
Revision as of 19:23, 26 October 2010
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