Team:HokkaidoU Japan/Notebook/September27

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(精製)
(ようやくSalmonella TyphimuriumのBACクローンが届いた)
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=ようやく''Salmonella Typhimurium''のBACクローンが届いた=
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=Finally Salmonella Typhimurium BAC library clones have arrived!=
* BAC clones of S. Typhimurium, B_STM07H21  '''SGSC4024'''  1464540-1562427
* BAC clones of S. Typhimurium, B_STM07H21  '''SGSC4024'''  1464540-1562427
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** 3型分泌装置をコードしている領域を含む
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** Codes Type 3 Secretion Aparatus
* BAC clones of S. Typhimurium, B_STM02P01 '''SGSC4014''' 837453-941863
* BAC clones of S. Typhimurium, B_STM02P01 '''SGSC4014''' 837453-941863
** 分泌シグナルをコードしている領域を含む
** 分泌シグナルをコードしている領域を含む

Revision as of 16:27, 21 October 2010

Finally Salmonella Typhimurium BAC library clones have arrived!

  • BAC clones of S. Typhimurium, B_STM07H21 SGSC4024 1464540-1562427
    • Codes Type 3 Secretion Aparatus
  • BAC clones of S. Typhimurium, B_STM02P01 SGSC4014 837453-941863
    • 分泌シグナルをコードしている領域を含む



BAC cloneの培養

25 ug/mL Chloramphenicol培地の作製

  • 25 ug/mL Chloramphenicol LB寒天培地を25枚作製
  • 25 ug/mL Chloramphenicol LB液体培地を2本作製

前培養

  • 培地を作製している間,送られてきたそれぞれの菌をAgar stabからLB液体培地に移して約2時間前培養した

培養

  • 前培養していたLBをそれぞれ2枚のプレートへ展開した
    • 片方は菌が薄くなるよう白金耳で展開し,もう片方には約300 uLを展開した
  • 前培養していたLB約1.5 mLを25 ug/mL Chloramphenicol LB液体培地へ加えた



Electroporation

精製

木曜日に作った1 ng/uLのBAC solutionの塩濃度を下げるため,Microcon YM-10で精製した

  • DNA solution 250 uLとDW450 uLをMicrocon YM-10のカラムに入れ,14,000rpm @4Cで1時間遠心した
  • 新しいチューブにカラムを逆さにつけて,14,000rpm @4Cで10分間遠心した
  • 30 uL回収できたため,220 uLのDWを加え,元の量にした

エレポ

精製したDNA solution 1 uLを用いて,DH5aとMG1655のエレポを行った

  • MG1655: 2.5 kV: 5.4 ms
  • DH5a: 2.49 kV: 5.7 ms
SOB 200 uLを加えてラウンドチューブに移して浸透しながら2時間培養し,Ampicillin培地に展開した