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From 2010.igem.org

Abstract Among the goals of iGEM is the creation of synthetic biological parts and their utilization to achieve novel features and behavior in biological systems. The emphasis of our project is put on this latter, "systems" aspect of iGEM. More precisely, we aim at the development and experimental demonstration of a scalable approach for the realization of logical functions in vivo. By developing a computational biological network based on RNA logical devices we will offer everyone the opportunity to 'program' their own cells with individual AND/OR/NOT connections between BioBricks of their choice. Thereby, BioBricks can finally fulfill their original assignment as biological parts that can be connected in many different ways. We will achieve this by engineering simple and easy-to-handle switches based on predictable RNA/RNA-interactions regulating transcriptional termination. These switches represent a complete set of logical functions and are capable of forming arbitrarily complex networks.

Zusammenfassung Das Entwerfen von neuen Bausteinen für die synthetische Biologie und ihr Zusammenfügen, um neue Funktionen und Charakteristika in biologische System zu bringen, sind mit die Hauptziele des iGEM-Wettbewerbes. Dabei wollen wir uns besonders auf letzteres konzentrieren und suchen eine systemische Anwendung von iGEM-Bausteinen zu etablieren. Unser Ziel ist es, einen skalierbaren Ansatz zu entwerfen, mit dem biologische Teile in vivo zu einem skalierbaren Netzwerk zusammengefügt werden können, das fähig ist zur logischen Informationsprozessierung. Durch die Entwicklung eines biologischen Netzwerkes, das analog zu einem Computer aufgebaut ist, bieten wir allen die Mögichkeit, Zellen zu programmieren und logische Netzwerke basierend auf AND/OR/NOT-Verbindungen zwischen Biobrick-Parts zu entwickeln. Dadurch können Biobricks auch endlich ihre Funktion als biologische Bausteine, die beliebig miteinander verknüpft werden können, erfüllen. Um das zu erreichen, haben wir einfache und benutzerfreundliche Schalter basierend auf berechenbaren RNA-RNA-Interaktion konstruiert, die durch Antitermination schalten können. Mit Hilfe dieser Schalter kann man komplette logische Funktionen aufbauen und beliebig komplexe Netzwerke entwerfen.