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プロジェクト

Dr. E. coli : 世界最小の注射器

   私たちのマインテーマは三型分泌装置という菌が持つ器官の中でも驚くべきものだと思います。この注射器に似た装置はタンパク質を菌の中から標的の真核細胞に打ち込むものです。しかしこの装置は病原性グラム陰性菌であるヤルシニアやサルモネラの器官です。私たちが非病原性の大腸菌を用いてそれを安全使えることを目指しました。

PCR用のアセンブリープロトコール

   時々、スタンダードプロトコールではプラスミドが増えなかったり、BioBrickがホストセルに有害で増幅されないことがある。こんな時にPCRはすごく役立つ。私たちはPCRを使った場合、制限酵素処理が合否がすぐ分かるように改善を加えました。

チーム

   北海道大学のigemのチームは日本で8番目につかれたチームです。一人のインストラクターと8人の学部生から構成されています。学部生の所属は理学部、医学部、農学部と様々です。今年、北大はチームはiGEM発出場である。

実験ノート

   成功と失敗の記録。失敗がたくさんあった道のりでしたがやってのけました。（実験ノートは英語でかかれています）

プロトコール

    私たちが使ったプロトコール集である。（現在英語、翻訳不定）

Parts

   We registered two parts associated with main project. One is a signal sequence that can be used to secrete tagged proteins through Type III Secretion Apparatus. The other is whole reporter construct to checks whether the Type III secretion system works correctly.

   Also, we registerd one primer set which is useful for the PCR based protocol.

Safety

   Addressing bio safety concerns

Acknowledgements

Laboratory and Personnel

• Ken-ichi Yamazaki
  • Associate Professor/Environmental Molecular Biology/Graduate School of Environmental Earth Science/Hokkaido University
• Hideaki Higashi
  • Associate Professor /Division of Molecular Oncology/ Institute for Genetic Medicine/ Hokkaido University
• Hisatoshi Shida
  • Professor/Molecular Biology/Institute for Genetic Medicine/ Hokkaido University
• Takashi Oohashi
  • Associate Professor /Division of Molecular Oncology/ Institute for Genetic Medicine/ Hokkaido University
• Members of Yamazaki Lab
• Masaaki　Morikawa
  • Professor/Environmental Molecular Biology/Graduate School of Environmental Earth Science/Hokkaido University
• Hidetoshi Okuyama
  • Associate Professor/Environmental Molecular Biology/Graduate School of Environmental Earth Science/Hokkaido University

Thank you for letting us use some of the lab equipment.

Academic Institutions

• Salmoneｌｌa Genetic Stock Center/University of Calgary
  • Provided E.coli with BAC vector library coding for Type 3 Secretion Apparatus and SlrP signal
• Graduate School of Environmental Earth Science
• Department of biological science/School of Sciense
• Institute for Genetic Medicine

Companies

• Amino Up Chemical
• ECONIXE
• Cosmo Bio
• Mendel　Workshop

Person

• Tadasu Emoto
  • Manager of ECONIXE