From 2010.igem.org
私たちはこれらのパーツを利用して、新たなbiobrickのパーツ作りに取り組みました
1.私たちはこれらのパーツを2010 iGEM kitから入手しました
Name | Part type | Resistance | Insert | Vector | Contents
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<partinfo>pSB3k3</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>) | Plasmid backbone | Kanamycin | 738bp | 2750bp | promoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
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<partinfo>pSB6A1</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>) | Plasmid backbone | Ampicillin | 738bp | 4032bp | promoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
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<partinfo>pSB1C3</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>) | Plasmid backbone | Chloramphenicol | 1069bp | 2072bp | promoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I3522</partinfo>) | Composite | Ampicillin | 937bp | 2079bp | promoter(TetR)+RBS+GFP+T+T
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_R0040</partinfo>) | Regulatory | Ampicillin | 54bp | 2079bp | promoter(TetR)
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I732019</partinfo>) | Regulatory | Ampicillin | 3230bp | 2079bp | RBS+LacZ+T+T
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<partinfo>pSB1AK3</partinfo>(<partinfo>BBa_I732950</partinfo>) | Protein domain | Kanamycin | 3230bp | 2079bp | RBS+LacZ+T+T
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<partinfo>pSB4A5</partinfo>(<partinfo>BBa_K193602</partinfo>) | Composite | Ampicillin | 1896bp | 3395bp |
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0240</partinfo>) | Protein domain | Ampicillin | 883bp | 2079bp | RBS+GFP+T+T
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I13507</partinfo>) | Protein domain | Ampicillin | 937bp | 2079bp | RBS+RFP+T+T
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0420</partinfo>) | Protein domain | Ampicillin | 878bp | 2079bp | RBS+CFP+T+T
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0430</partinfo>) | Protein domain | Ampicillin | 878bp | 2079bp | RBS+YFP+T+T
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I13600</partinfo>) | Composite | Ampicillin | 940bp | 2079bp | promoter(TetR)+RBS+CFP+T+T
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<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_J22005</partinfo>) | Composite | Ampicillin | 2079bp | 2623bp | promoter(TetR)+RBS+YFP+T+T
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2.このパーツはiGEM本部から直接入手しました
私たちは、以下のパーツについて新しい情報を付加しました。このパーツは低コピーベクターであるpSB6を利用してGFPを発現するように設計されていますが、発現効率が記載されていませんでした。一般的に、低コピーベクターは高コピーベクターに比べタンパク質の発現効率が良いと言われています。しかし、この情報はiGEMのHPのどのページを見渡しても見つけることができませんでした。したがって、私たちは、低コピーベクターpSB6と高コピーベクターであるpSB1を比較しタンパク質の発現効率を調査しました。その結果、このパーツは、高コピーベクターであるpSB1に比べ非常に効率よくタンパク質を発現することが分かり、このパーツをプロモーターの機能を調査しタンパク質発現のために用いることにしました。このパーツを作製した09年東工大チームに心から感謝いたします。
Name | Part Type | Resistance | Insert | Vector |
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<partinfo>pSB6A1</partinfo>(<partinfo>BBa_K121013</partinfo>) | Protein domain | Ampicillin | 883bp | 4022bp | RBS+GFP+T+T
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