Template:KIT-Kyoto-September1

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Revision as of 08:00, 26 September 2010

September 1

【時間】

9:00～

【実験担当】

古道

【実験目的】

(1)　pSB1A2(E0420)、pSB1A2(E0430)、

pSB1A2(I13507)、pSB6A1(K121013)のアルカリミニプレップ、DNA濃度測定

(2)　アルカリミニプレップ済の

pSB1A2(E0420)9/1付け、pSB1A2(E0430)9/1付け、

pSB1A2(I13507)9/1付け、pSB6A1(K121013)の制限酵素処理

【実験内容】

(1)　pSB1A2(E0420)、pSB1A2(E0430)、

pSB1A2(I13507)、pSB6A1(K121013)のアルカリミニプレップ、DNA濃度測定

　培養済のpSB1A2(E0420)、pSB1A2(E0430)、

　pSB1A2(I13507)、pSB6A1(K121013)を1.5mlエッペンに集菌した

　↓菌体を氷令したSoltionⅠ100µlに懸濁しvortexした

　↓SoltionⅡ200µl加え混合し氷上に5分放置した

　↓SoltionⅢ150µl加え混合し氷上に5分放置した

　↓4℃、14,000rpmで10分間遠心した

　↓上清を回収しφOH/CIAAを200µl加え14000rpmで5分間遠心した

　↓上清を回収しCIAA を200µl加え14000rpmで5分間遠心した

　↓上清を回収し400µlのイソプロパノールを加え混ぜた

　↓4℃、14,000rpmで20分間遠心した

　↓上澄みを捨て70％エタノールを200µl加えvortexした

　↓4℃、14,000rpmで10分間遠心した

　↓上澄みを捨てて5分間、37℃インキュベートで乾燥させた

　↓RNase入りTE(10µg/ml)30µlを加え37℃で30分間インキュベートした

　↓吸光度測定をした

　↓8/31にアルカリミニプレップ処理をしたpSB1A2(E0420)、

　　pSB1A2(E0430)、pSB1A2(I13507)も吸光度測定を行った

(2)　アルカリミニプレップ済の

pSB1A2(E0420)9/1付け、pSB1A2(E0430)9/1付け、

pSB1A2(I13507)9/1付け、pSB6A1(K121013)の制限酵素処理

　下の組成の通りに1.5mlエッペンに分注した

	pSB6A1 (BBa_K121013)	pSB1A2 (BBa_E0420:CFP)	pSB1A2 (BBa_I13507:RFP)	pSB1A2 (BBa_E0430:YFP)
DNA	80µl	70µl	110µl	90µl
H₂O	9.4µl	19.4µl	24.4µl	44.4µl
H buffer	10µl	10µl	15µl	15µl
EcoRⅠ	0.3µl	0.3µl	0.3µl	0.3µl
PstⅠ	0.3µl	0.3µl	0.3µl	0.3µl
total	100µl	100µl	150µl	150µl

　↓37℃で一晩インキュベートした

【実験結果】

(1)　吸光度測定結果

8/31付け pSB1A2(E0420) (100倍希釈)
	1.176
	1.120
	1.104
	1.089
	1.088
平均	1.1154
濃度：5.58×10³(µg/ml)

8/31付け pSB1A2(BBa_E0430:YFP) (100倍希釈)
	1.322
	1.310
	1.309
	1.292
	1.286
平均	1.3038
濃度：6.51×10³(µg/ml)

8/31付け pSB1A2(I13507) (100倍希釈)
	1.134
	1.114
	1.110
	1.102
	1.104
平均	1.1128
濃度：5.56×10³(µg/ml)

9/1付け pSB1A2(BBa_E0420:CFP) (100倍希釈)
	1.318
	1.309
	1.316
	1.320
	1.327
平均	1.318
濃度：6.59×10³(µg/ml)

9/1付け pSB1A2(E0430) (100倍希釈)
	1.567
	1.538
	1.528
	1.516
	1.490
平均	1.5278
濃度：7.64×10³(µg/ml)

9/1付け pSB1A2(I13507) (100倍希釈)
	1.193
	1.169
	1.196
	1.188
	1.189
平均	1.187
濃度：5.935×10³(µg/ml)

pSB6A1(K121013) (100倍希釈)
	1.390
	1.390
	1.378
	1.362
	1.336
平均	1.3712
濃度：6.91×10³(µg/ml)

(2)　一晩、制限酵素処理した後、DNA抽出を行う

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 【実験目的】
-:(1)　pSB1A2(BBa_E0420:CFP)、pSB1A2(BBa_E0430:YFP)、
+:(1)　pSB1A2(E0420)、pSB1A2(E0430)、
-::pSB1A2(BBa_I13507:RFP)、pSB6A1(BBa_K121013)のアルカリミニプレップ、DNA濃度測定
+::pSB1A2(I13507)、pSB6A1(K121013)のアルカリミニプレップ、DNA濃度測定
 :(2)　アルカリミニプレップ済の
-::pSB1A2(BBa_E0420:CFP)9/1付け、pSB1A2(BBa_E0430:YFP)9/1付け、
+::pSB1A2(E0420)9/1付け、pSB1A2(E0430)9/1付け、
-::pSB1A2(BBa_I13507:RFP)9/1付け、pSB6A1(BBa_K121013)の制限酵素処理
+::pSB1A2(I13507)9/1付け、pSB6A1(K121013)の制限酵素処理
 【実験内容】
-:(1)　pSB1A2(BBa_E0420:CFP)、pSB1A2(BBa_E0430:YFP)、
+:(1)　pSB1A2(E0420)、pSB1A2(E0430)、
-::pSB1A2(BBa_I13507:RFP)、pSB6A1(BBa_K121013)のアルカリミニプレップ、DNA濃度測定
+::pSB1A2(I13507)、pSB6A1(K121013)のアルカリミニプレップ、DNA濃度測定
-::　培養済のpSB1A2(BBa_E0420:CFP)、pSB1A2(BBa_E0430:YFP)、
+::　培養済のpSB1A2(E0420)、pSB1A2(E0430)、
-::　pSB1A2(BBa_I13507:RFP)、pSB6A1(BBa_K121013)を1.5mlエッペンに集菌した
+::　pSB1A2(I13507)、pSB6A1(K121013)を1.5mlエッペンに集菌した
 ::　↓菌体を氷令したSoltionⅠ100µlに懸濁しvortexした
 ::　↓SoltionⅡ200µl加え混合し氷上に5分放置した
@@ Line 33: / Line 33: @@
 ::　↓RNase入りTE(10µg/ml)30µlを加え37℃で30分間インキュベートした
 ::　↓吸光度測定をした
-::　↓8/31にアルカリミニプレップ処理をしたpSB1A2(BBa_E0420:CFP)、
+::　↓8/31にアルカリミニプレップ処理をしたpSB1A2(E0420)、
-::　　pSB1A2(BBa_E0430:YFP)、pSB1A2(BBa_I13507:RFP)も吸光度測定を行った
+::　　pSB1A2(E0430)、pSB1A2(I13507)も吸光度測定を行った
 :(2)　アルカリミニプレップ済の
-::pSB1A2(BBa_E0420:CFP)9/1付け、pSB1A2(BBa_E0430:YFP)9/1付け、
+::pSB1A2(E0420)9/1付け、pSB1A2(E0430)9/1付け、
-::pSB1A2(BBa_I13507:RFP)9/1付け、pSB6A1(BBa_K121013)の制限酵素処理
+::pSB1A2(I13507)9/1付け、pSB6A1(K121013)の制限酵素処理
 ::　下の組成の通りに1.5mlエッペンに分注した
@@ Line 65: / Line 65: @@
 ::<TABLE BORDER="0"><TR>
 ::<TD><TABLE BORDER="0"><TR>
-::<TD COLSPAN="2">8/31付け<BR>pSB1A2(BBa_E0420:CFP)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
+::<TD COLSPAN="2">8/31付け<BR>pSB1A2(E0420)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
 ::<TR>
 ::<TD ROWSPAN="5"></TD><TD>1.176</TD></TR>
@@ Line 101: / Line 101: @@
 ::<TD></TD><TD></TD>
 ::<TD><TABLE BORDER="0"><TR>
-::<TD COLSPAN="2">8/31付け<BR>pSB1A2(BBa_I13507:RFP)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
+::<TD COLSPAN="2">8/31付け<BR>pSB1A2(I13507)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
 ::<TR>
 ::<TD ROWSPAN="5"></TD><TD>1.134</TD></TR>
@@ Line 137: / Line 137: @@
 ::<TR>
 ::<TD><TABLE BORDER="0"><TR>
-::<TD COLSPAN="2">9/1付け<BR>pSB1A2(BBa_E0430:YFP)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
+::<TD COLSPAN="2">9/1付け<BR>pSB1A2(E0430)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
 ::<TR>
 ::<TD ROWSPAN="5"></TD><TD>1.567</TD></TR>
@@ Line 155: / Line 155: @@
 ::<TD></TD><TD></TD>
 ::<TD><TABLE><TR>
-::<TD COLSPAN="2">9/1付け<BR>pSB1A2(BBa_I13507:RFP)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
+::<TD COLSPAN="2">9/1付け<BR>pSB1A2(I13507)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
 ::<TR>
 ::<TD ROWSPAN="5"></TD><TD>1.193</TD></TR>
@@ Line 173: / Line 173: @@
 ::<TD></TD><TD></TD>
 ::<TD><TABLE BORDER="0"><TR>
-::<TD COLSPAN="2"><BR>pSB6A1(BBa_K121013)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
+::<TD COLSPAN="2"><BR>pSB6A1(K121013)<BR>(100倍希釈)</TD></TR>
 ::<TR>
 ::<TD ROWSPAN="5"></TD><TD>1.390</TD></TR>