Team:HokkaidoU Japan/Notebook/August30
From 2010.igem.org
(Difference between revisions)
(→電気泳動) |
(→ラオリプライマーで作ったパーツも同様にdigestion) |
||
Line 97: | Line 97: | ||
{|style="text-align:center;" class="protocol" | {|style="text-align:center;" class="protocol" | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996; border-bottom:1px solid #996;"| |
- | |colspan="4" style="border-right:1px solid # | + | |colspan="4" style="border-right:1px solid #996; border-bottom:1px solid #996;"|RBS |
- | |colspan="4" style="border-right:1px solid # | + | |colspan="4" style="border-right:1px solid #996; border-bottom:1px solid #996;"|dT |
- | |colspan="4" style="border-bottom:1px solid # | + | |colspan="4" style="border-bottom:1px solid #996;"|GFP |
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|DNA |
|1 uL | |1 uL | ||
|1 uL | |1 uL | ||
|1 uL | |1 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|1 uL |
|1 uL | |1 uL | ||
|1 uL | |1 uL | ||
|1 uL | |1 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|1 uL |
|1 uL | |1 uL | ||
|1 uL | |1 uL | ||
Line 116: | Line 116: | ||
|1 uL | |1 uL | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|DW |
|17 uL | |17 uL | ||
|14 uL | |14 uL | ||
|14 uL | |14 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|13 uL |
|17 uL | |17 uL | ||
|14 uL | |14 uL | ||
|14 uL | |14 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|13 uL |
|17 uL | |17 uL | ||
|14 uL | |14 uL | ||
Line 130: | Line 130: | ||
|13 uL | |13 uL | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|10x M buffer |
|2 uL | |2 uL | ||
|2 uL | |2 uL | ||
|2 uL | |2 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|2 uL |
|2 uL | |2 uL | ||
|2 uL | |2 uL | ||
|2 uL | |2 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|2 uL |
|2 uL | |2 uL | ||
|2 uL | |2 uL | ||
Line 144: | Line 144: | ||
|2 uL | |2 uL | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|0.1% BSA |
|- | |- | ||
|2 uL | |2 uL | ||
|2 uL | |2 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|2 uL |
|- | |- | ||
|2 uL | |2 uL | ||
|2 uL | |2 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|2 uL |
|- | |- | ||
|2 uL | |2 uL | ||
Line 158: | Line 158: | ||
|2 uL | |2 uL | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|EcoR I |
|- | |- | ||
|1 uL | |1 uL | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|1 uL |
|- | |- | ||
|1 uL | |1 uL | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|1 uL |
|- | |- | ||
|1 uL | |1 uL | ||
Line 172: | Line 172: | ||
|1 uL | |1 uL | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|Pst I |
|- | |- | ||
|- | |- | ||
|1 uL | |1 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|1 uL |
|- | |- | ||
|- | |- | ||
|1 uL | |1 uL | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996;"|1 uL |
|- | |- | ||
|- | |- | ||
Line 186: | Line 186: | ||
|1 uL | |1 uL | ||
|- | |- | ||
- | |style="border-right:1px solid # | + | |style="border-right:1px solid #996; border-top:1px solid #996;"|Total |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996; border-right:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996; border-right:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
- | |style="border-top:1px solid # | + | |style="border-top:1px solid #996;"|20 uL |
|} | |} | ||
[[Image:HokkaidoU Japan 20100830a.jpg|200px|right|thumb|]] | [[Image:HokkaidoU Japan 20100830a.jpg|200px|right|thumb|]] |
Revision as of 07:06, 20 September 2010
pUC119のEcoR I, Pst I digestion
- | EcoR I | Pst I | E, P | 古いEcoR I | |
DNA solution | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL |
DW | 17 uL | 14 uL | 14 uL | 13 uL | 14 uL |
10x M buffer | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL |
0.1% BSA | - | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL |
EcoR I | - | 1 uL | - | 1 uL | 1 uL |
Pst I | - | - | 1 uL | 1 uL | - |
Total | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL |
→37℃, 60 min
→2 uLを電気泳動で確認
- バカ橋さんがDNAを入れ忘れたためやりなおし
- 残った18 uLにDW1 uLとDNAを加えて
→37℃, 60 min
→2 uLを電気泳動で確認(+ 0.4 uL 6x SB)
電気泳動
Lane | DNA |
2 | λ/Hind III, EcoR I(4 uL使用) |
3 | 切ってない |
4 | EcoR I |
5 | Pst I |
6 | EcoR I + Pst I |
7 | 古いEcoR I |
- レーン3ではモノマー,ダイマー,トライマーなどのプラスミドが見られる.
- レーン4~7ではこれらが切れているのが分かる
- リニアになったので,モノマーの環状DNA(超コイル)より流れにくい
ラオリプライマーで作ったパーツも同様にdigestion
RBS | dT | GFP | ||||||||||
DNA | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL | 1 uL |
DW | 17 uL | 14 uL | 14 uL | 13 uL | 17 uL | 14 uL | 14 uL | 13 uL | 17 uL | 14 uL | 14 uL | 13 uL |
10x M buffer | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL | 2 uL |
0.1% BSA | - | 2 uL | 2 uL | 2 uL | - | 2 uL | 2 uL | 2 uL | - | 2 uL | 2 uL | 2 uL |
EcoR I | - | 1 uL | - | 1 uL | - | 1 uL | - | 1 uL | - | 1 uL | - | 1 uL |
Pst I | - | - | 1 uL | 1 uL | - | - | 1 uL | 1 uL | - | - | 1 uL | 1 uL |
Total | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL | 20 uL |
→同様にインキュベート&電気泳動
電気泳動
- マーカーはλ/Hind III, EcoR Iと50bp のラダーマーカー
- ほかは上の表の通り
- ちゃんと切れてる