Template:KIT-Kyoto-Augsut13
From 2010.igem.org
(Difference between revisions)
Matsubara3 (Talk | contribs) |
Matsubara3 (Talk | contribs) (→August 13) |
||
Line 5: | Line 5: | ||
【実験担当】 | 【実験担当】 | ||
:岩城,竹内,中村,吉村,足立 | :岩城,竹内,中村,吉村,足立 | ||
- | |||
- | |||
- | |||
- | |||
- | |||
【実験目的】 | 【実験目的】 | ||
- | :(1) | + | :(1) 12日にLB(+amp)で間違えて培養していたため、LB(+kan)で再度pSB3K3のトランスフォーメーションをする |
- | :(2) | + | :(2) 前日に培養したpSB1A2(J44000)及びpSB6A1(J04450)のプラスミド抽出 |
- | :(3) | + | :(3) DH5αに目的プラスミドpSB1A2(J44000)及びpSB6A1(J04450)が挿入されているか制限酵素処理をすることによって確かめる |
【実験内容】 | 【実験内容】 | ||
- | :(1) | + | :(1) pSB3K3(J04450)のトランスフォーメーション |
:: -80℃で保存していたコンピタントセル(DH5α)を氷上で溶解した | :: -80℃で保存していたコンピタントセル(DH5α)を氷上で溶解した | ||
:: ↓DH5α100μLに対し、pSB3K3 1μLを1.5mLエッペンに混合した | :: ↓DH5α100μLに対し、pSB3K3 1μLを1.5mLエッペンに混合した | ||
:: ↓on ice 30min | :: ↓on ice 30min | ||
- | :: | + | :: ↓45℃で45sec、過熱した |
:: ↓on ice 2min | :: ↓on ice 2min | ||
:: ↓各チューブにSOC培地を、0.9mLずつ加えた | :: ↓各チューブにSOC培地を、0.9mLずつ加えた | ||
Line 27: | Line 22: | ||
:: ↓培養後、全量をLBプレート(+kan)に撒き、37℃でOvernight | :: ↓培養後、全量をLBプレート(+kan)に撒き、37℃でOvernight | ||
- | :(2) pSB1A2 | + | :(2) pSB1A2(J44000)及びpSB6A1(J04450)のミニプレップ |
- | :: | + | :: 培養後のpSB1A2(J44000)とpSB6A1(J04450)を1.5mLチューブに取った |
:: ↓4℃、15,000rpmで5分間遠心した | :: ↓4℃、15,000rpmで5分間遠心した | ||
:: ↓上澄みをデカンテーションで取り除いた | :: ↓上澄みをデカンテーションで取り除いた | ||
Line 46: | Line 41: | ||
:: ↓RNase in TEを30μL加えてプラスミドDNAにした | :: ↓RNase in TEを30μL加えてプラスミドDNAにした | ||
- | :(3) pSB1A2 | + | :(3) pSB1A2(J44000)及びpSB6A1(J04450)の制限酵素処理と電気泳動 |
- | :<TABLE BORDER="0"><TR> | + | ::<TABLE BORDER="0"><TR> |
- | :<TD><TABLE BORDER="1"><TR> | + | ::<TD><TABLE BORDER="1"><TR> |
- | :<TD></TD><TD> | + | ::<TD></TD><TD>pSB1A2(J44000)</TD><TD>pSB6A1(J04450)</TD></TR> |
- | :<TR> | + | ::<TR> |
- | :<TD>''XbaⅠ'',''PstⅠ''</TD><TD>1μL</TD><TD>1μL</TD></TR> | + | ::<TD>''XbaⅠ'',''PstⅠ''</TD><TD>1μL</TD><TD>-</TD></TR> |
- | :<TR> | + | ::<TR> |
- | :<TD>(2)で得たpSB1A2</TD><TD>5μL</TD><TD>-</TD></TR> | + | ::<TD>''EcoRⅠ'',''SpeⅠ''</TD><TD>-</TD><TD>1μL</TD></TR> |
- | :<TR> | + | ::<TR> |
- | :<TD>(2)で得たpSB6A1</TD><TD>-</TD><TD>5μL</TD></TR> | + | ::<TD>(2)で得たpSB1A2<BR>プラスミド</TD><TD>5μL</TD><TD>-</TD></TR> |
- | :<TR> | + | ::<TR> |
- | :<TD>H<SUB>2</SUB>O</TD><TD>11μL</TD><TD>11μL</TD></TR> | + | ::<TD>(2)で得たpSB6A1<BR>プラスミド</TD><TD>-</TD><TD>5μL</TD></TR> |
- | :<TR> | + | ::<TR> |
- | :<TD>H Buffer</TD><TD>1μL</TD><TD>2μL</TD></TR> | + | ::<TD>H<SUB>2</SUB>O</TD><TD>11μL</TD><TD>11μL</TD></TR> |
- | :<TR> | + | ::<TR> |
- | :<TD>M Buffer</TD><TD>1μL</TD><TD>-</TD></TR> | + | ::<TD>H Buffer</TD><TD>1μL</TD><TD>2μL</TD></TR> |
- | :<TR> | + | ::<TR> |
- | :<TD>計</TD><TD>20μL</TD><TD>20μL</TD></TR> | + | ::<TD>M Buffer</TD><TD>1μL</TD><TD>-</TD></TR> |
- | :</TABLE></TD> | + | ::<TR> |
- | :<TD></TD><TD></TD> | + | ::<TD>計</TD><TD>20μL</TD><TD>20μL</TD></TR> |
- | :<TD><TABLE BORDER="0"><TR> | + | ::</TABLE></TD> |
- | :<TD> | + | ::<TD></TD><TD></TD> |
- | :37℃で1時間インキュベートした | + | ::<TD><TABLE BORDER="0"><TR> |
- | :↓Loading Bufferを1μLそれぞれに加え、コームに流した | + | ::<TD> |
- | : (マーカーは1kbp radderを使用した) | + | ::右の組成で1.5mlチューブ内で混合した |
- | :↓100Vで30分間電気泳動し、EtBr(10mg/mL)で染色した | + | ::37℃で1時間インキュベートした |
- | :↓泳動結果を写真で撮影した<BR></TD></TR></TABLE> | + | ::↓Loading Bufferを1μLそれぞれに加え、コームに流した |
- | :</TD></TR></TABLE> | + | :: (マーカーは1kbp radderを使用した) |
+ | ::↓100Vで30分間電気泳動し、EtBr(10mg/mL)で染色した | ||
+ | ::↓泳動結果を写真で撮影した<BR></TD></TR></TABLE> | ||
+ | ::</TD></TR></TABLE> | ||
【実験結果】 | 【実験結果】 | ||
- | :(1) | + | :(1) 2つのコロニーの生育を確認した(ピンク) |
+ | :(2,3) pSB6A1(J04450)→2本のバンドが確認できたことにより、目的プラスミドの挿入が確認できた | ||
+ | :: pSB1A2(J44000)→バンドが検出できなかった | ||
- | :( | + | 【実験考察】 |
- | : | + | :(1) |
- | + | :(2,3) 翌日から組み換え大腸菌の大量培養に入る | |
- | :: | + | :: 翌日、再度カットしなおして電気泳動を行う |
Revision as of 03:28, 26 September 2010
August 13
【時間】
- 9:00~21:00
【実験担当】
- 岩城,竹内,中村,吉村,足立
【実験目的】
- (1) 12日にLB(+amp)で間違えて培養していたため、LB(+kan)で再度pSB3K3のトランスフォーメーションをする
- (2) 前日に培養したpSB1A2(J44000)及びpSB6A1(J04450)のプラスミド抽出
- (3) DH5αに目的プラスミドpSB1A2(J44000)及びpSB6A1(J04450)が挿入されているか制限酵素処理をすることによって確かめる
【実験内容】
- (1) pSB3K3(J04450)のトランスフォーメーション
- -80℃で保存していたコンピタントセル(DH5α)を氷上で溶解した
- ↓DH5α100μLに対し、pSB3K3 1μLを1.5mLエッペンに混合した
- ↓on ice 30min
- ↓45℃で45sec、過熱した
- ↓on ice 2min
- ↓各チューブにSOC培地を、0.9mLずつ加えた
- ↓37℃で1h、振とう培養した
- ↓培養後、全量をLBプレート(+kan)に撒き、37℃でOvernight
- (2) pSB1A2(J44000)及びpSB6A1(J04450)のミニプレップ
- 培養後のpSB1A2(J44000)とpSB6A1(J04450)を1.5mLチューブに取った
- ↓4℃、15,000rpmで5分間遠心した
- ↓上澄みをデカンテーションで取り除いた
- ↓菌体ペレットを氷冷したSoltionⅠ100μLに懸濁した(vortex)
- ↓SolutionⅡ200μLを加え混合した(vortex不可)
- ↓5min on ice
- ↓SolutionⅢ150μLを加え混合した(vortex)
- ↓5min on ice
- ↓4℃、15,000rpm、10min遠心した
- ↓上澄みを新しい1.5mLマイクロチューブに移した
- ↓等量(400μL)イソプロピルアルコールを加えた
- ↓4℃、15,000rpmで20分間遠心した
- ↓70%EtOHを1mL加えた(vortex)
- ↓4℃、15,000rpm、10分間遠心した
- ↓上澄みを捨てた
- ↓30秒間遠心乾燥を行った
- ↓RNase in TEを30μL加えてプラスミドDNAにした
- (3) pSB1A2(J44000)及びpSB6A1(J04450)の制限酵素処理と電気泳動
pSB1A2(J44000) pSB6A1(J04450) XbaⅠ,PstⅠ 1μL - EcoRⅠ,SpeⅠ - 1μL (2)で得たpSB1A2
プラスミド5μL - (2)で得たpSB6A1
プラスミド- 5μL H2O 11μL 11μL H Buffer 1μL 2μL M Buffer 1μL - 計 20μL 20μL - 右の組成で1.5mlチューブ内で混合した
- 37℃で1時間インキュベートした
- ↓Loading Bufferを1μLそれぞれに加え、コームに流した
- (マーカーは1kbp radderを使用した)
- ↓100Vで30分間電気泳動し、EtBr(10mg/mL)で染色した
- ↓泳動結果を写真で撮影した
【実験結果】
- (1) 2つのコロニーの生育を確認した(ピンク)
- (2,3) pSB6A1(J04450)→2本のバンドが確認できたことにより、目的プラスミドの挿入が確認できた
- pSB1A2(J44000)→バンドが検出できなかった
【実験考察】
- (1)
- (2,3) 翌日から組み換え大腸菌の大量培養に入る
- 翌日、再度カットしなおして電気泳動を行う