Team:HokkaidoU Japan/Notebook/September3

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(→1-3AのPCR)
(→前日のトラフォメの結果)
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-
=前日のトラフォメの結果=
+
=Resultsof yesterdays trnsformation=
-
* pSB1C3を使ったトラフォメは全滅だった
+
* pSB1C3 uterly failed to produce colonies
-
* pUC119では計20個ほどのコロニーしか得られなかった
+
* pUC119 produced 20 colonies
-
* 赤くなるはずが，赤くなっていなかったので，目的のInsertが入っていない可能性がある．
+
* colonies that should been red because of RFP insert wasn`t, so there is posibility that insert wasn`t there
=前日のトラフォメ菌の[[コロニーPCR]]=
=前日のトラフォメ菌の[[コロニーPCR]]=

Revision as of 17:24, 27 September 2010

Notebook

Resultsof yesterdays trnsformation

  • pSB1C3 uterly failed to produce colonies
  • pUC119 produced 20 colonies
  • colonies that should been red because of RFP insert wasn`t, so there is posibility that insert wasn`t there

前日のトラフォメ菌のコロニーPCR

  • プロトコル：コロニーPCRに従って，実験した
  • 今回は20サンプルで行った

電気泳動

前日に使用したパーツの濃度測定

HokkaidoU Japan 20100903a.jpg

Ligationに使用したDNA solutionが予想通りの濃度だったのか確認した

Lane DNA
1
2 λ/Hind III, EcoR I
3
4 RFP
5 pUC119
6 pSB1C3

1-3AのPCR

1-3AはpSB1C3に載ったRFP reporterで，トラフォメに成功している
ベクターとして配布されたpSB1C3が悪い可能性を見るため，このパーツのpSB1C3を増幅して使用する

Reagent Amount
1-3A 1
DW 33
10x Buffer 5
2 M 4dNTPs 5
25 mM MgSO4 3
Suffix-F 1
Prefix-R 1
KOD 1
Total 50 uL
  • extensionは120 sec
  • YM-10でClean Upしたら43 uLになった
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