Template:KIT-Kyoto/Parts1

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(→2.このパーツはiGEM本部から直接入手しました)
 
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== Vector ==
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== 私たちはこれらのパーツを利用して、新たなbiobrickのパーツ作りに取り組みました ==
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=== 1.私たちはこれらのパーツを2010 iGEM kitから入手しました ===
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== Insert ==
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=== 2.このパーツはiGEM本部から直接入手しました ===
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私たちは2009年の東京工業大学のグループによって設計されたBioBrick Part(pSB6A1)に新情報を加えました。 このBioBrick Partは、<I>E.coli</I>でGFPを発現するように設計された低コピープラスミドであるpSB6を骨格としています。一般に、低コピープラスミドは、pSB1のような高コピープラスミドと比較してタンパク質発現の効率が高い。しかしながら、このプラスミドに関してGFPタンパク質発現の効率に関する定量的なデータはiGEMのどんなサイトでも説明されていませんでした。よって、pSB6A1とpSB1A2のプラスミドをもつ<I>E.coli</I>で生産されるGFPタンパク質の蛍光強度を測定しました。結果、pSB1A2をもつ<I>E.coli</I>と比較してpSB6A1もつ<I>E.coli</I>ではGFPの発現レベルが高いことが明らかにわかりました。このようにして、我々はH<sub>2</sub>O<sub>2</sub>に応答する様々なプロモーターの活性を測定するのにpSB6のベクターを使用することに決めました。 私たちは、2009年にこれを開発した東京工業大学のグループに感謝します。
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!Name||Resistance||Insert Length||Vector Length||Comment
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!Name||Part Type||Resistance||Insert||Vector||Contents|
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|<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I3522</partinfo>)||Ampicillin||937||2079||promoter(TetR)+RBS+GFP+T+T
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|<partinfo>pSB4A5</partinfo>(<partinfo>BBa_K193602</partinfo>)||Ampicillin||1896||3395||promoter(Lac)+RBS+melA+T+T
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|<partinfo>pSB6A1</partinfo>(<partinfo>BBa_K121013</partinfo>)||Ampicillin||883||4022||RBS+GFP+T+T
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|<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0240</partinfo>)||Ampicillin||883||2079||RBS+GFP+T+T
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|<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_J22005</partinfo>)||Ampicillin||2079||2623||promoter(TetR)+RBS+YFP+T+T
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Latest revision as of 14:03, 26 October 2010

私たちはこれらのパーツを利用して、新たなbiobrickのパーツ作りに取り組みました

1.私たちはこれらのパーツを2010 iGEM kitから入手しました

NamePart typeResistanceInsertVectorContents
<partinfo>pSB3k3</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>)Plasmid backboneKanamycin738bp2750bppromoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
<partinfo>pSB6A1</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>)Plasmid backboneAmpicillin738bp4032bppromoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
<partinfo>pSB1C3</partinfo>(<partinfo>BBa_J04450</partinfo>)Plasmid backboneChloramphenicol1069bp2072bppromoter(LacI) +RBS+mRFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I3522</partinfo>)CompositeAmpicillin937bp2079bppromoter(TetR)+RBS+GFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_R0040</partinfo>)RegulatoryAmpicillin54bp2079bppromoter(TetR)
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I732019</partinfo>)RegulatoryAmpicillin3230bp2079bpRBS+LacZ+T+T
<partinfo>pSB1AK3</partinfo>(<partinfo>BBa_I732950</partinfo>)Protein domainKanamycin3230bp2079bpRBS+LacZ+T+T
<partinfo>pSB4A5</partinfo>(<partinfo>BBa_K193602</partinfo>)CompositeAmpicillin1896bp3395bp
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0240</partinfo>)Protein domainAmpicillin883bp2079bpRBS+GFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I13507</partinfo>)Protein domainAmpicillin937bp2079bpRBS+RFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0420</partinfo>)Protein domainAmpicillin878bp2079bpRBS+CFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_E0430</partinfo>)Protein domainAmpicillin878bp2079bpRBS+YFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_I13600</partinfo>)CompositeAmpicillin940bp2079bppromoter(TetR)+RBS+CFP+T+T
<partinfo>pSB1A2</partinfo>(<partinfo>BBa_J22005</partinfo>)CompositeAmpicillin2079bp2623bppromoter(TetR)+RBS+YFP+T+T

2.このパーツはiGEM本部から直接入手しました

私たちは2009年の東京工業大学のグループによって設計されたBioBrick Part(pSB6A1)に新情報を加えました。 このBioBrick Partは、E.coliでGFPを発現するように設計された低コピープラスミドであるpSB6を骨格としています。一般に、低コピープラスミドは、pSB1のような高コピープラスミドと比較してタンパク質発現の効率が高い。しかしながら、このプラスミドに関してGFPタンパク質発現の効率に関する定量的なデータはiGEMのどんなサイトでも説明されていませんでした。よって、pSB6A1とpSB1A2のプラスミドをもつE.coliで生産されるGFPタンパク質の蛍光強度を測定しました。結果、pSB1A2をもつE.coliと比較してpSB6A1もつE.coliではGFPの発現レベルが高いことが明らかにわかりました。このようにして、我々はH2O2に応答する様々なプロモーターの活性を測定するのにpSB6のベクターを使用することに決めました。 私たちは、2009年にこれを開発した東京工業大学のグループに感謝します。

NamePart TypeResistanceInsertVector
<partinfo>pSB6A1</partinfo>(<partinfo>BBa_K121013</partinfo>)Protein domainAmpicillin883bp4022bpRBS+GFP+T+T
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