Template:KIT-Kyoto-Augsut13

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【時間】
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:9:00~21:00
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【時間】 9:00~21:00
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【実験担当】
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:岩城,竹内,中村,吉村,足立
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【実験担当】岩城,竹内,中村,吉村,足立
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【実験名】
【実験名】
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:(1)pSB3K3のトランスフォーメーション
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:(1) pSB3K3のトランスフォーメーション
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:(2)pSB1A2,pSB6A1のアルカリミニプレップ
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:(2) pSB1A2,pSB6A1のアルカリミニプレップ
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:(3)pSB1A2,pSB6A1の電気泳動
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:(3) pSB1A2,pSB6A1の電気泳動
【実験目的】
【実験目的】
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:(1)LB(+amp)で間違えて培養していたため、LB(+kan)で再度pSB3K3のトランスフォーメーション をする
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:(1) LB(+amp)で間違えて培養していたため、LB(+kan)で再度pSB3K3のトランスフォーメーションをする
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:(2)pSB1A2及びpSB6A1のプラスミド抽出
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:(2) pSB1A2及びpSB6A1のプラスミド抽出
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:(3)DH5αにプラスミドpSB1A2及びpSB6A1が挿入されているかのチェック
+
:(3) DH5αにプラスミドpSB1A2及びpSB6A1が挿入されているかのチェック
-
+
 
【実験内容】
【実験内容】
-
:(1)-80℃で保存していたコンピタントセル(DH5α)を氷上で溶解
+
:(1) pSB3K3のトランスフォーメーション
-
:          ↓
+
:: -80℃で保存していたコンピタントセル(DH5α)を氷上で溶解した
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:  DH5α100μLに対し、pSB3K3 1μLを、1.5mLエッペンに混合
+
:: ↓DH5α100μLに対し、pSB3K3 1μLを1.5mLエッペンに混合した
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:          ↓
+
:: ↓on ice 30min
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:  on ice 30min
+
:: ↓45℃で45sec、ヒートショックを行った
-
:          ↓
+
:: ↓on ice 2min
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:  45℃で45sec、ヒートショック
+
:: ↓各チューブにSOC培地を、0.9mLずつ加えた
-
:          ↓
+
:: ↓37℃で1h、振とう培養した
-
:  on ice 2min
+
:: ↓培養後、全量をLBプレート(+kan)に撒き、37℃でOvernight
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:          ↓
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:  各チューブにSOC培地を、0.9mLずつ加えた
+
:(2) pSB1A2,pSB6A1のアルカリミニプレップ
-
:          ↓
+
培養後のpSB1A2とpSB6A1を1.5mLチューブに取った
-
:  37℃で1h、振とう培養
+
↓4℃、15,000rpmで5分間遠心した
-
:          ↓
+
↓上澄みをデカンテーションで取り除いた
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:  培養後、全量をLBプレート(+kan)に撒き、37℃でOvernight
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↓菌体ペレットを氷冷したSoltionⅠ100μLに懸濁した(vortex)
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:(2)培養後のpSB1A2とpSB6A1を1.5mL
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  ↓
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:  ↓4℃、15,000rpm、5min遠心
+
 
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:上澄みをデカンテーションで取り除く
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SolutionⅡ200μLを加え混合(vortex不可)
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:  ↓
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:菌体ペレットを氷冷したSoltionⅠ100μLに懸濁(vortex)
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  ↓5min on ice
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:  ↓
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:SolutionⅡ200μLを加え混合(vortex不可)
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SolutionⅢ150μLを加え混合(vortex)
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:  ↓5min on ice
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:SolutionⅢ150μLを加え混合(vortex)
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  ↓5min on ice
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:  ↓5min on ice
+
 
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:4℃、15,000rpm、10min遠心
+
4℃、15,000rpm、10min遠心
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:  ↓
+
 
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:上澄みを新しい1.5mLマイクロチューブに移す
+
  ↓
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:  ↓
+
 
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:等量(400μL)イソプロピルアルコールを加える
+
上澄みを新しい1.5mLマイクロチューブに移す
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:  ↓4℃、15,000rpm、20min遠心
+
 
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:70%EtOHを1mL加える(vortex)
+
  ↓
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:  ↓4℃、15,000rpm、10min遠心
+
 
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:上澄みを捨てる
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等量(400μL)イソプロピルアルコールを加える
-
: ↓30sec 遠心乾燥
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:RNase in TE30μL加えてプラスミドDNAにする
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  ↓4℃、15,000rpm、20min遠心
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70%EtOHを1mL加える(vortex)
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  ↓4℃、15,000rpm、10min遠心
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上澄みを捨てる
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 ↓30sec 遠心乾燥
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RNase in TE30μL加えてプラスミドDNAにする
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(3)
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<組成1>pSB1A2
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 XbaⅠ,PstⅠ・・・・1μL
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 (2)で得られたpSB1A2プラスミド・・・5μL
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 H2O・・・・・・・・11μL
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 H Buffer・・・・・・1μL
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 M Buffer・・・・・・1μL
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計20μL
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<組成2>pSB6A1
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 EcoRⅠ,ScaⅠ・・・・1μL
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 (2)で得られたpSB6A1プラスミド・・・5μL
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 H2O・・・・・・・・11μL
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 H Buffer・・・・・・2μL
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計20μL
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1h,37℃でインキュベート
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:(3)
 
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:<組成1>pSB1A2
 
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: XbaⅠ,PstⅠ・・・・1μL
 
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: (2)で得られたpSB1A2プラスミド・・・5μL
 
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: H2O・・・・・・・・11μL
 
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: H Buffer・・・・・・1μL
 
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: M Buffer・・・・・・1μL
 
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:計20μL
 
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:
 
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:<組成2>pSB6A1
 
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: EcoRⅠ,ScaⅠ・・・・1μL
 
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: (2)で得られたpSB6A1プラスミド・・・5μL
 
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: H2O・・・・・・・・11μL
 
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: H Buffer・・・・・・2μL
 
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:計20μL
 
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:1h,37℃でインキュベート
 
        ↓
        ↓
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: Loading Buffer 1μLをそれぞれに加えコームに流した
+
 
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:(マーカーは1kbp radderを使用した)
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Loading Buffer 1μLをそれぞれに加えコームに流した
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:        ↓
+
 
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:100V,30min電気泳動しEtBr(10mg/mL)で染色
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(マーカーは1kbp radderを使用した)
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:        ↓
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:泳動結果を写真で撮影した
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        ↓
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100V,30min電気泳動しEtBr(10mg/mL)で染色
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        ↓
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泳動結果を写真で撮影した
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【実験結果】
【実験結果】
-
:(1)コロニーが2つだけ確認(ピンク)。
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(1)コロニーが2つだけ確認(ピンク)。(3)pSB6A1→Bandが確認、挿入が確かめられた。翌日から組み換え大腸菌の大量培養に入る。
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:(3)pSB6A1→Bandが確認、挿入が確かめられた。翌日から組み換え大腸菌の大量培養に入る。
+
  pSB1A2→Bandが現れなかった。翌日、再度カットしなおして電気泳動する。
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:  pSB1A2→Bandが現れなかった。翌日、再度カットしなおして電気泳動する。
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-
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+

Revision as of 04:49, 15 September 2010

August 13

【時間】

9:00~21:00

【実験担当】

岩城,竹内,中村,吉村,足立

【実験名】

(1) pSB3K3のトランスフォーメーション
(2) pSB1A2,pSB6A1のアルカリミニプレップ
(3) pSB1A2,pSB6A1の電気泳動

【実験目的】

(1) LB(+amp)で間違えて培養していたため、LB(+kan)で再度pSB3K3のトランスフォーメーションをする
(2) pSB1A2及びpSB6A1のプラスミド抽出
(3) DH5αにプラスミドpSB1A2及びpSB6A1が挿入されているかのチェック

【実験内容】

(1) pSB3K3のトランスフォーメーション
 -80℃で保存していたコンピタントセル(DH5α)を氷上で溶解した
 ↓DH5α100μLに対し、pSB3K3 1μLを1.5mLエッペンに混合した
 ↓on ice 30min
 ↓45℃で45sec、ヒートショックを行った
 ↓on ice 2min
 ↓各チューブにSOC培地を、0.9mLずつ加えた
 ↓37℃で1h、振とう培養した
 ↓培養後、全量をLBプレート(+kan)に撒き、37℃でOvernight
(2) pSB1A2,pSB6A1のアルカリミニプレップ

培養後のpSB1A2とpSB6A1を1.5mLチューブに取った ↓4℃、15,000rpmで5分間遠心した ↓上澄みをデカンテーションで取り除いた ↓菌体ペレットを氷冷したSoltionⅠ100μLに懸濁した(vortex)

  ↓

SolutionⅡ200μLを加え混合(vortex不可)

  ↓5min on ice

SolutionⅢ150μLを加え混合(vortex)

  ↓5min on ice

4℃、15,000rpm、10min遠心

  ↓

上澄みを新しい1.5mLマイクロチューブに移す

  ↓

等量(400μL)イソプロピルアルコールを加える

  ↓4℃、15,000rpm、20min遠心

70%EtOHを1mL加える(vortex)

  ↓4℃、15,000rpm、10min遠心

上澄みを捨てる

 ↓30sec 遠心乾燥

RNase in TE30μL加えてプラスミドDNAにする


(3) <組成1>pSB1A2  XbaⅠ,PstⅠ・・・・1μL

 (2)で得られたpSB1A2プラスミド・・・5μL

 H2O・・・・・・・・11μL

 H Buffer・・・・・・1μL

 M Buffer・・・・・・1μL

計20μL



<組成2>pSB6A1  EcoRⅠ,ScaⅠ・・・・1μL

 (2)で得られたpSB6A1プラスミド・・・5μL

 H2O・・・・・・・・11μL

 H Buffer・・・・・・2μL

計20μL



1h,37℃でインキュベート

        ↓

Loading Buffer 1μLをそれぞれに加えコームに流した

(マーカーは1kbp radderを使用した)

        ↓

100V,30min電気泳動しEtBr(10mg/mL)で染色

        ↓

泳動結果を写真で撮影した


【実験結果】 (1)コロニーが2つだけ確認(ピンク)。(3)pSB6A1→Bandが確認、挿入が確かめられた。翌日から組み換え大腸菌の大量培養に入る。   pSB1A2→Bandが現れなかった。翌日、再度カットしなおして電気泳動する。