Team:HokkaidoU Japan/Notebook/August24

From 2010.igem.org

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(いろいろ確認)
(ラオリプライマーで増やしたパーツの確認)
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=ラオリプライマーで増やしたパーツの確認=
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=Check to see if digestion visualization Primers Work=
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[[Image:HokkaidoU Japan 20100824a.jpg|200px|right|thumb|]]
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* 4つのPCR productsをそれぞれMicrocon YM-10でろ過し,電気泳動にかけた
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[[Image:HokkaidoU Japan 20100824a.jpg|200px|right|thumb|Electrophoresis after restriction enzyme digestion‎]]
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* All 4 of PCR products were purified via Microcon YM-10
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{| class="protocol"
{| class="protocol"
|'''Lane'''
|'''Lane'''
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|Promoter
|Promoter
|}
|}
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Promoter band in lane 6 wasn't visible
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レーン6のプロモータはバンドが見られなかった
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* This vector didn't have a primer annealing site for our new primers
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* 配列を確認したところ,ラオリプライマーが対応していないベクターに載っていた.
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=Ligation Mixtureのチェック=
=Ligation Mixtureのチェック=

Revision as of 05:46, 22 September 2010

Check to see if digestion visualization Primers Work

Electrophoresis after restriction enzyme digestion‎
  • All 4 of PCR products were purified via Microcon YM-10
Lane DNA
1 TSUDA Marker I
3 RBS
4 GFP
5 double terminator
6 Promoter

Promoter band in lane 6 wasn't visible

  • This vector didn't have a primer annealing site for our new primers

Ligation Mixtureのチェック

Ligation Mixture「I」とLigation Mixture「M」について

  • PCRで増やしてゲル抽したpSB1C3 2 uLにLigation Mixture 4 uLをいれ,それぞれのTransformationした
  • LB 200 uLを加え,100 uLずつをChloramphenicol 34 ug/uLと 12 ug/uLの培地にまいた

いろいろ確認

HokkaidoU Japan 20100824b.jpg
Lane DNA
2 λ/Hind III
3 pSB1C3どうしのLigation
4 ラオリプライマーによる1-2NのPCRのろ過産物(上)
5 ラオリプライマーによる1-2NのPCRのろ過(下)
6 λ/Hind III
7 ゲル抽したpSB1C3

レーン3でバンドが見られなかった.

  • ダイマー,テトラマーなど,さまざまな断片ができ,薄くなってしまった?

レーン7は薄いがバンドが確認できた

  • ゲル抽に問題はない